Посетители пещер знают, что там царит темнота, с потолка капает вода, иногда слышно шуршание. Таинственность пещер всегда привлекала людей, поэтому в биологии выделен раздел – биоспелеология,  изучаеющий фауну пещер. В той кромешной темноте живут троглобионты, троглофилы и троглоксены.

К троглобионтам относятся животные, проводящие под землёй всю жизнь. У них почти отсутствует окраска, нет глаз, тело покрыто щетинками и чувствительными усиками ведь подземным существам приходится двигаться на ощупь. Мухи здесь похожи на жуков, которые потеряли крылья, а жуки – на муравьёв.

В подземных озёрах обитает пятьдесят видов белёсых рыб. Рачки-бокоплавы живут здесь по десять, пятнадцать лет (на поверхности суши их собратья существуют только два года). Причина в том, что в пещерах держится постоянная температура, нет ветра, дождя и солнца. Здесь такая влажность, что водные животные могут долго находиться на суше, а сухопутные спокойно передвигаются по дну водоёма. Троглобионты питаются листьями и веточками растений, которые попали в пещеру с помётом летучих мышей, бактериями из ила подземных озёр и другими простейшими. Среди летучих мышей: ночницы, северные кожанки и ушаны никогда не покидают подземных жилищ.

К троглофилам относят животных обитающих под землёй и на поверхности земли: летучие мыши вечерницы, нетопыри, кожаны, подковоносы, длиннокрылы, козодои-гуахаро оранжево-коричневого цвета, стрижи-саланганы. В Анкаранской пещере, когда пересыхают болота, по подземной реке заплывают крокодилы. От сильной жары сюда прячутся крабы, креветки и рыбы.

Случайно попавшую под землю живность называют троглоксены. С потоками воды сюда попадают жуки, пауки, каракатицы, ветром может надуть бабочек и других насекомых.